若房子是犯罪所得购买且用于犯罪活动，即便有贷款，司法机关会依法没收该房产。对于未还清的贷款，银行作为债权人，可向法院申报债权。经法院核实后，从拍卖、变卖该房产所得款项中优先清偿银行贷款，剩余部分作为没收财产上缴国库。

若房子是合法财产但被用于抵押获取贷款，没收财产时遵循“先偿债后没收”原则。司法机关会对房产进行评估拍卖，所得款项先偿还银行贷款，因为银行对抵押房产有优先受偿权。偿还完贷款后剩余的财产，才会被依法没收。

若犯罪人还有其他合法财产可供执行没收财产刑，法院会考虑先执行其他财产，尽量保障债权人（银行）的合法权益和抵押房产的稳定性，避免因房产被没收影响银行债权实现。