(一)性质不同

1、检察院是国家的法律监督机关，同时也是公诉案件的审查起诉机关。其主要职责是负责审查批准逮捕，其自侦案件的侦查，以及审查起诉，和所有公诉案件的提起公诉与出庭作控方。

2、法院是国家的审判机关，其主要职责是依法行使审判权，包括民事案件，刑事案件和行政案件的审判。 法院与上级法院之间是审判监督关系，不是检察院之间的领导关系。

(二)职能不同

1、法院的职责主要是依据法律作出裁判，另外还有强制执行职责。

2、检察院的职责是对执法机关(主要是行政机关)及司法机关(主要是法院和公安)进行监督。检察院除了承担提出公诉外，还承担对贪污、渎职、滥用职权等犯罪的侦查、对犯罪嫌疑人的审查批准逮捕、对监狱等改造机关的监督等等职责。

法院与检察院的主要联系是检察院有权依法监督法院的审判过程，并对法院的违法审判有权提出纠纷意见与提出抗诉等。 在刑事公诉案件中，检察院和法院以及公安是分工协作，互相配合，互相监督的关系。一般来说，公安机关是侦察机关,检察院是监督和刑事起诉机关,法院是审判机关。一个案子立案以后，由公安机关侦察，收集证据,如果认为要起诉就把所有案卷资料移送至检察院,如果检察院审核后决定起诉,就由检察院起诉,由法院审判，这是对于刑事诉讼来说的。

(三)监督与被监督的关系

检察院自己对贪污贿赂等国家工作人员犯罪案件有侦察权，可以自己立案侦察起诉，而对于公安机关的侦察工作和法院的审判工作,检察院是监督的作用。对于民事和行政案件，检察院可以通过当事人申诉或法院审判委员会反映向法院抗诉。总的来说，检察院和法院就是一个监督和被监督的关系，在刑事诉讼中，检察院,辩护方和法院组成一个等腰三角形关系。